1991年に発足されたJNICを前身とし、1993年にJPNICへと改組された。設立当初はJPドメイン名の割り当て業務も行っていたが、2002年よりJPRS（株式会社日本レジストリサービス）にすべて移管している。
インターネットの円滑な運営を支えるための組織で、具体的には日本におけるグローバルIPアドレスを運用と管理や、インターネットにかかわる各種の調査・研究や教育・啓発活動などを行っている。